Los chamorros, los habitantes originales de Guam, no usaron banderas, ni se creó ninguna bandera de Guam mientras Guam fue gobernada por España (1521–1898). Guam quedó bajo la administración de Estados Unidos después de la Guerra Hispanoamericana de 1898 y se le otorgó formalmente el estatus territorial en 1950. La entrada de Estados Unidos en la Primera Guerra Mundial inspiró a Helen L. Paul, la esposa de un oficial naval estadounidense estacionado en Guam, a diseñar un bandera. Se parecía a muchas banderas estatales de EE. UU. En el sentido de que tenía un emblema (también creado por Paul) centrado en un campo azul. La forma del emblema se asemeja a las piedras de honda que alguna vez usaron los Chamorros para la caza y el deporte. La escena muestra la desembocadura del río Hagåtña (Agana) con un cocotero en primer plano. Two Lovers 'Leap, el acantilado al fondo, recuerda una historia tradicional. Una forma de canoa con estabilizadores que se utilizaba anteriormente completa el diseño.
Esta bandera fue adoptada oficialmente por el gobierno territorial el 4 de julio de 1917 y reconfirmada el 12 de mayo de 1931. Las fuerzas japonesas ocuparon Guam durante casi tres años durante la Segunda Guerra Mundial. En conmemoración de las penurias sufridas durante ese período, se agregó un borde rojo a la bandera el 9 de febrero de 1948.
