Samoa no tenía banderas antes de la llegada de los europeos a principios del siglo XVIII, y la historia de las banderas nacionales de Samoa en el siglo XIX es compleja y no está completamente documentada. En 1899, Gran Bretaña, Alemania y Estados Unidos acordaron dividir Samoa. La bandera de EE. UU. Se izó oficialmente sobre Samoa Americana el 17 de abril de 1900 y siguió siendo la única bandera oficial durante los siguientes 60 años. El gobierno local se desarrolló y expandió gradualmente para involucrar a una proporción cada vez mayor de la población de Samoa. Como resultado, la idea de una bandera local se discutió por primera vez en la década de 1950. Los líderes locales y el Instituto de Heráldica del Ejército de los EE. UU. Crearon la bandera actual basándose en las ideas presentadas por la población de Samoa. Se hizo oficial el 27 de abril de 1960, el día en que entró en vigor la primera constitución de Samoa Americana y el 60 aniversario del primer levantamiento de los EE. UU.bandera en Samoa.
El rojo, el blanco y el azul de la bandera son colores tradicionales tanto en Samoa como en los Estados Unidos. El águila sobre la marcha sostiene en sus garras dos emblemas tradicionales de Samoa, un batidor de moscas ( fue ) y un garrote de guerra ( uatogi ). El primero simboliza la sabiduría de los jefes tradicionales de Samoa y el segundo representa el poder del estado.
